「国際原核生物命名規約で2021年に名称が変わった門」を、超文系人間が調べてみた
生物は、進化してきた道すじで分類されています。
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| Wikipediaより |
そしてドメイン（Domain）・界（Kingdom）・門（Phylum）・綱（Class）・目（Order）・科（Family）・属（Genus）・種（Species）という階層があります。
例えば人間は、次のとおりです。
○ドメイン 真核生物
○界 動物界
○門 脊椎動物門
○綱 哺乳網（哺乳類）
○目 霊長目
○科 ヒト科
○属 ヒト属
○種 ホモ・サピエンス
動植物につける世界共通の名前が、学名です。学名に使われるのは属名と種小名（しゅしょうめい）で、原則としてラテン語の斜体で表記します。この2つを列記する方法である二名法（にめいほう）は、スウェーデンの博物学者で「分類学の父」と呼ばれているカール・フォン・リンネが考案しました（著書『自然の体系』1735年)。
細菌（バクテリア）とアーキア（古細菌）、つまり原核生物は、国際原核生物命名規約（International Code of Nomenclature of Prokaryotes; ICNP）に沿って、学名がつけられています。なお、真核生物であるカビや酵母については、国際藻類・菌類・植物命名規約 (International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants; ICN)です。
国際原核生物命名規約では、国際微生物学会連合（IUMS）の公式誌である“International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology（IJSEM）”に掲載されることで正式に学名が発表されたことになります。
次世代シークエンサーの普及などで、複数の遺伝子の塩基配列や全染色体の塩基配列を比較することが可能になりました。そのため、種・属・科にとどまらず、目・綱・門での相互関係を明らかになっています。
2021年には、国際原核生物命名規約に門の命名ルールが追加され、語尾が-otaに統一されました。
■2021年に名称が変わった門の一部
○バチルス属や乳酸菌の門 Firmicutes（ファーミキューテス）門→Bacillota（バチロータ、バシラス）門
○Bacteroidetes（バクテロイデーテス）門→Bacteroidota（バクテロイドータ）門
○大腸菌やシュードモナス属の門 Proteobacteria（プロテオバクテリア）門→Pseudomonadota（シュードモナドータ、シュードモナス）門
○抗生物質を作る菌やビフィズス菌などの放線菌の門 Actinobacteria（アクチノバクテリア）門→Actinomycetota（アクチノマイセトータ、アクチノマイセス）門
人間の腸内細菌は1000種に及ぶといわれていますが、バチロータ門・バクテロイドータ門・シュードモナドータ門・アクチノマイセトータ門の4つがほとんどを占めています。
また、腸内細菌は、８種のビタミンB群（ビタミンB1、ビタミンB2、ナイアシン、パントテン酸、ビタミンB6、ビオチン、葉酸、ビタミンB12）と脂溶性ビタミンであるビタミンKを産生しています。
■腸内細菌と、産生すると確認・推測がされているビタミン
○バチロータ門を除く細菌、特にバクテロイドータ門とフソバクテリオータ門：チアミン（ビタミンB1）
○バクテロイドータ門、フソバクテリオータ門、シュードモナドータ門、バチロータ門の一部、ビフィドバクテリウム・ロングム：リボフラビン（ビタミンB2）
○大半の腸内細菌：ナイアシン（ビタミンB3） ※バチロータ門とアクチノマイセトータ門の細菌は他より合成能を持つ細菌が少ない
○バクテロイドータ門、シュードモナドータ門：パントテン酸（ビタミンB5）
○大部分のアクチノマイセトータ門、バクテロイドータ門およびシュードモナドータ門：ピリドキシン（ビタミンB6）
○バクテロイドータ門、フソバクテリオータ門、大部分のシュードモナドータ門：ビオチン（ビタミンB7）
○バクテロイドータ門、フソバクテリオータ門、シュードモナドータ門、バクテロイデス属、ビフィズス菌、レンサ球菌、ラクトコッカス：葉酸（ビタミンB9）
○フソバクテリオータ門、バクテロイドータ門の一部、クロストリジウム綱、リモシラクトバチルス・ロイテリ：コバラミン（ビタミンB12）
○バクテロイデス・フラジリス、バクテロイデス・オバツス、バクテロイデス・ブルガタス、バクテロイデス・テタイオタオミクロン：メナキノン（ビタミンK）
■主な参考資料
マイクロバイオーム関連細菌を中心とした最新の細菌分類情報
5分でわかる！二名法
微生物名ってどうやって決まるの？
バイオテクノロジー
腸内細菌によるビタミン産生（Vitamin production by gut bacteria）
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